Ecologie microbienne et grands défis sociétaux
La connaissance des écosystèmes marins et de leur fonctionnement permet d’identifier des métabolismes et des traits fonctionnels microbiens. La prise en considération de l’impact humain dans les écosystèmes permet d’identifier les cibles potentielles d’amélioration de nos activités pour amoindrir leur effet ou des outils exploitant les ressources microbiennes. L’équipe MEB mettra à disposition de la société les savoirs acquis au niveau fondamental pour proposer des améliorations ou nouvelles solutions répondant aux problématiques de grands enjeux sociétaux. Ces réponses passent bien entendu par des questionnements scientifiques mais aussi par des développements technologiques adaptés.
Les problématiques de la valorisation des déchets (municipaux, agricoles, d’aquaculture,…) par des microorganismes marins pourront être couplées aux problématiques de production de bioénergies (Hydrogène, Méthane, Micro-algues, ,…). La compréhension et l’amélioration des bioprocédés seront possibles grâce à la connaissance des microorganismes, de leurs métabolismes et des contrôles viraux associés, via des approches omiques, et grâce aux installations pilotes de l’équipe, automatisées et instrumentalisées, permettant le suivi analytique de réacteurs en conditions contrôlées . Ces recherches seront développées en interaction forte avec les pays du Sud, notamment dans le cadre du LMI Biotech H2, et avec des partenaires industriels.
La maîtrise de biomarqueurs des activités anthropiques et les connaissances acquises sur les dynamiques et activités microbiennes dans les zones urbanisées et/ou exploitées par les humains constitueront des outils d’aide à la décision en gestion de l’environnement. Par exemple, la gestion des activités portuaires au travers d’indicateurs permettra de gérer les risques en priorisant les actions en fonction de leur impact. De la même manière, le développement d’indicateurs pour comprendre les éléments régissant le système microbien au sein des mangroves permettra d’intégrer des informations supplémentaires dans les problématiques de suivi de la qualité des eaux.